RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GRINAQ7Z429 371 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 LRGUKQ96M69 825 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 TRIM15Q9C019 465 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 MUC13Q9H3R2 512 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 NANOGQ9H9S0 305 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 SLAMF8Q9P0V8 285 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.77□□□□□ -0.53
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CTIF-210ENST00000591412 SULT2B1O00204 365 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 PMS2P2O95744 297 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 LY6G6DO95868 133 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CHRM4P08173 479 aa11.76□□□□□ -0.53
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CTIF-210ENST00000591412 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 IGHV1-2P23083 117 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RYKP34925 604 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GSK3BP49841 420 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 MAPK11Q15759 364 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GPAT3Q53EU6 434 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RABL3Q5HYI8 236 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CMIPQ8IY22 773 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ZNF563Q8TA94 476 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GTF2H4Q92759 462 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ARL5BQ96KC2 179 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 OR52E6Q96RD3 313 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 PANX1Q96RD7 426 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CGREF1Q99674 301 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 BDH2Q9BUT1 245 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 VCX3BQ9H321 246 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 LIPT1Q9Y234 373 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 DPRXA6NFQ7 191 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ZNF716A6NP11 495 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTIF-210ENST00000591412 DNPH1O43598 174 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 LYZL6O75951 148 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 PGM3O95394 542 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 GSNP06396 782 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CD3EP07766 207 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 DANCRP0C864 163 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ACADSP16219 412 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 NTF4P34130 210 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 MVDP53602 400 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 HPCAP84074 193 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.75□□□□□ -0.53
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CTIF-210ENST00000591412 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
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CTIF-210ENST00000591412 NEUROG1Q92886 237 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ZNF570Q96NI8 536 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RMND5AQ9H871 391 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 NGBQ9NPG2 151 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 AP4S1Q9Y587 144 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 AQP12BA6NM10 295 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 FAAHO00519 579 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 CLOCKO15516 846 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RAMP1O60894 148 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 SOD3P08294 240 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 TFPIP10646 304 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-210ENST00000591412 ATP6V1B2P21281 511 aa11.74□□□□□ -0.53
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