RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OR7A5Q15622 319 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ACKR1Q16570 336 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RNF220Q5VTB9 566 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM225Q6GV28 225 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 REEP3Q6NUK4 255 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KRT73Q86Y46 540 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC103Q8IW40 242 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf82Q8WW14 230 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 APH1AQ96BI3 265 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 DNPH1O43598 174 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CASP12Q6UXS9 341 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZT83 130 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA11Q86U17 422 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GPAT4Q86UL3 456 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 MUCL1Q96DR8 90 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF607Q96SK3 696 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 SCOCQ9UIL1 159 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MTORP42345 2549 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF716A6NP11 495 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GSC2O15499 205 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF9O43307 516 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RAMP1O60894 148 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RAD51DO75771 328 aa7.36□□□□□ -1.23
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