RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR51D1Q8NGF3 324 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR13F1Q8NGS4 319 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 IL1F10Q8WWZ1 152 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT22Q9BRQ3 303 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CENPOQ9BU64 300 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 IMPA1P29218 277 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PKLRP30613 574 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC1A3P43003 542 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PPT1P50897 306 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF17Q02223 184 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZP2Q05996 745 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FAM57BQ71RH2 274 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MIB2Q96AX9 1013 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HCAR1Q9BXC0 346 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HOXC13P31276 330 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A3R2Q15599 337 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CLVS2Q5SYC1 327 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR4K15Q8NH41 348 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RSPRY1Q96DX4 576 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC14A1Q13336 389 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 NHSL2Q5HYW2 709 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 IDO2Q6ZQW0 420 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SERTAD4Q9NUC0 356 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OSGIN1Q9UJX0 560 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 EPHA4P54764 986 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RNF4P78317 190 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM201Q5SNT2 666 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A31Q9H0C2 315 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT9Q9HCQ5 603 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SRPK3Q9UPE1 567 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SURF4O15260 269 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CSO75390 466 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 KCNIP4Q6PIL6 250 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ARGFXA6NJG6 315 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ACOD1A6NK06 481 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM12O43184 909 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GDF1P27539 372 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CREB3L2Q70SY1 520 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GCM1Q9NP62 436 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HCSTQ9UBK5 93 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HIDE1A8MVS5 230 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DPM1O60762 260 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK5O95279 499 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OLAHQ9NV23 265 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A7Q9Y694 548 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM10O14672 748 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 C22orf15Q8WYQ4 148 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RAB9BQ9NP90 201 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS44E7EML9 344 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FURINP09958 794 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 BMP1P13497 986 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HBMQ6B0K9 141 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR56B4Q8NH76 319 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP19Q8WTR2 217 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJB11Q9UBS4 358 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 H0YGG7 62 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ATP1B3P54709 279 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CLDN12P56749 244 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP8Q86W28 1048 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FUCA1P04066 466 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HMGN3Q15651 99 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PXDC1Q5TGL8 231 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF425Q6IV72 752 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 B3GLCTQ6Y288 498 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC19A3Q9BZV2 496 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TAAR2Q9P1P5 351 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 H7C1C5 153 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PEX14O75381 377 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CHRM4P08173 479 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RAB38P57729 211 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 LCN6P62502 163 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 COX20Q5RI15 118 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 C18orf63Q68DL7 685 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSR9 355 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PIGCQ92535 297 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FGF13Q92913 245 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms