RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PSD2	Q9BQI7	771 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EXD2	Q9NVH0	621 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	WDR45	Q9Y484	360 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ROS1	P08922	2347 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EVPLL	A8MZ36	301 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	C5orf58	C9J3I9	102 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		E7EQL1	145 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FRS3	O43559	492 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EFNA2	O43921	213 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KIAA0513	O60268	411 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CYTIP	O60759	359 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	STX11	O75558	287 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	UGT2B17	O75795	530 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NTN1	O95631	604 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NUDT14	O95848	222 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PRKCA	P17252	672 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	COX5A	P20674	150 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PTN	P21246	168 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ENPP1	P22413	925 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IGHV1-2	P23083	117 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CD40	P25942	277 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SHC1	P29353	583 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC7A1	P30825	629 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RYK	P34925	604 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FABP6	P51161	128 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CBX1	P83916	185 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MXRA7	P84157	204 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HOXC5	Q00444	222 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF117	Q03924	483 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FOXF1	Q12946	379 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SELENBP1	Q13228	472 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SCARB2	Q14108	478 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KLHL26	Q53HC5	615 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CBLN3	Q6UW01	205 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FITM2	Q8N6M3	262 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF525	Q8N782	197 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RNF148	Q8N7C7	305 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OR10A6	Q8NH74	314 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LRRC58	Q96CX6	371 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FKRP	Q9H9S5	495 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RLIM	Q9NVW2	624 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EMC3	Q9P0I2	261 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PRSS50	Q9UI38	385 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CIB4	A0PJX0	185 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SERINC4	A6NH21	518 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	DUXA	A6NLW8	204 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	AP3D1	O14617	1153 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GPR171	O14626	319 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	DCTN3	O75935	186 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CSTA	P01040	98 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	TFPT	P0C1Z6	253 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	GKN3P	P0CG01	181 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	UBL4A	P11441	157 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CCNA2	P20248	432 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PAX7	P23759	505 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	IGFBP5	P24593	272 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	PDLIM4	P50479	330 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SLC7A2	P52569	658 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	ATP12A	P54707	1039 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	SLC25A3	Q00325	362 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CS-233	ENST00000552688	CDK6	Q00534	326 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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