RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 C8orf4Q9NR00 106 aa18.36■□□□□ 0.53
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TSTA3-215ENST00000532308 NPIPA3F8WFD2 350 aa18.35■□□□□ 0.53
TSTA3-215ENST00000532308 BCKDKO14874 412 aa18.35■□□□□ 0.53
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TSTA3-215ENST00000532308 GTF3C1Q12789 2109 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 29.2
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TSTA3-215ENST00000532308 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.33■□□□□ 0.52
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TSTA3-215ENST00000532308 SYNGR4O95473 234 aa18.32■□□□□ 0.52
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TSTA3-215ENST00000532308 ENPP1P22413 925 aa18.32■□□□□ 0.52
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TSTA3-215ENST00000532308 PMS2P3Q13401 168 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 ZBED5Q49AG3 693 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 ZPLD1Q8TCW7 415 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-215ENST00000532308 SLC29A1Q99808 456 aa18.32■□□□□ 0.52
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