RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	CDA	P32320	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GJC1	P36383	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FOLR3	P41439	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ACTR1B	P42025	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CDKN2B	P42772	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GNPDA1	P46926	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	AVPR1B	P47901	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKAG1	P54619	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	P2RX3	P56373	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TAS2R50	P59544	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB11A	P62491	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EGR4	Q05215	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PMPCA	Q10713	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DGCR6	Q14129	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RCAN2	Q14206	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB11B	Q15907	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR180	Q86V85	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CADM3	Q8N126	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMF1	Q92530	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IDS	B3KWA1	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KLF11	O14901	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NDUFS4	O43181	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SCN2B	O60939	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6A2	O95222	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	APOC2	P02655	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MT-ND1	P03886	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LYN	P07948	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MLN	P12872	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CPA3	P15088	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HNF1A	P20823	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	S1PR1	P21453	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPD1	P21695	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PCMT1	P22061	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IDS	P22304	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EPHB2	P29323	1055 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DCTD	P32321	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNG1	P51959	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NUP107	P57740	925 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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