RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 TPST2O60704 377 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 11.4
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SH3BP2-208ENST00000504294 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 GUSBP1Q15486 140 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 SSX8Q7RTT4 187 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 DHFR2Q86XF0 187 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 LIX1LQ8IVB5 337 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK20Q8IZL9 346 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF148Q8N7C7 305 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 ASB9Q96DX5 294 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 HDHD5Q9BXW7 423 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR6A2O95222 327 aa12.97□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN1O95832 211 aa12.97□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 RPS5P46782 204 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1E2P47887 323 aa12.97□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 TRAM2Q15035 370 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF11Q15544 211 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 RINLQ6ZS11 566 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 COMTD1Q86VU5 262 aa12.97□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD3Q8WU67 409 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A36Q96CQ1 311 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF347Q96SE7 839 aa12.97□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 ENPP4Q9Y6X5 453 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 RELNP78509 3460 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa12.96□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-208ENST00000504294 NDEL1Q9GZM8 345 aa12.96□□□□□ -0.33
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SH3BP2-208ENST00000504294 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 MED12Q93074 2177 aa12.96□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 EBAG9O00559 213 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 CGAP01215 116 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 MT-ND1P03886 318 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 POU2F1P14859 743 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF43P17038 809 aa12.95□□□□□ -0.34
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SH3BP2-208ENST00000504294 TFF3Q07654 80 aa12.95□□□□□ -0.34
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