RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRLHRP49683 370 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFNA3P52797 238 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 29.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDGFAP04085 211 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F13BP05160 661 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OTX2P32243 289 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIPAP38571 399 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XCR1P46094 333 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GHSRQ92847 366 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM227AF5H4B4 570 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SULT2B1O00204 365 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPPPO94811 219 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNK5O95279 499 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R46P59540 309 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAZQ16635 292 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PELI3Q8N2H9 469 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.98■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC16A6O15403 523 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB1D1O95968 90 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKLRP30613 574 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSNK1A1P48729 337 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCR6P51684 374 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCTD11Q693B1 232 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MZB1Q8WU39 189 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RADILQ96JH8 1075 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2A25A4D2G3 310 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APLNRP35414 380 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPV4 95 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR137BO60478 399 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBL3O95164 117 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1SP09871 688 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDOSTP39656 456 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIPAL2Q9H841 368 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIRPAP78324 504 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPLD1P80108 840 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGAP1Q75T13 922 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX19Q8NA77 164 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADOQ96SZ5 270 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C20orf85Q9H1P6 137 aa15.97■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A6NL46 340 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOCS6O14544 535 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NME2P22392 152 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDUAP35475 653 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ILKQ13418 452 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AIFM1O95831 613 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTR3AP46098 478 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNJ10P78508 379 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AVPI1Q5T686 147 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKMYT1Q99640 499 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOR1AO14656 332 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OPN1LWP04000 364 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSNK1DP48730 415 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAREM2Q75VX8 874 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CADM3Q8N126 398 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFP82Q8N141 532 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOX4Q9NPH5 578 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNG13Q9P2W3 67 aa15.96■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO9BQ13459 2157 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB2A2Q13296 93 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q6ZSR9 355 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.96■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPEG1Q2M385 716 aa15.95■□□□□ 0.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTBL2Q562R1 376 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms