RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334		V9GY05	133 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	NSD2	O96028	1365 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TRDC	B7Z8K6	153 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TAPBP	O15533	448 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	LGI1	O95970	557 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	HNF1A	P20823	631 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	MMP11	P24347	488 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	PPT1	P50897	306 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	PRPS1	P60891	318 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	SELENOT	P62341	195 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TGFBR3	Q03167	851 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	SSX2	Q16385	188 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	RUFY3	Q7L099	469 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	ANKFN1	Q8N957	763 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	SYT14	Q8NB59	555 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	BBOF1	Q8ND07	529 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	UCN3	Q969E3	161 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	SLC35E1	Q96K37	410 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	MBOAT4	Q96T53	435 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TSG101	Q99816	390 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	RAB18	Q9NP72	206 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	PRO0461	Q9UI25	63 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-231	ENST00000477334	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	LTBP1	Q14766	1721 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1B0GUA9	196 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		A6NIZ1	184 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	GFY	I3L273	518 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	DCTN6	O00399	190 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ARPC3	O15145	178 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MED7	O43513	233 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SERPINA3	P01011	423 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334		P04436	131 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	LGALS2	P05162	132 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HSMCR30	P0CW71	290 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NUDT1	P36639	197 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PTGDS	P41222	190 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	KLK7	P49862	253 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HLCS	P50747	726 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RAP1B	P61224	184 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MESD	Q14696	234 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM123	Q8N131	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR2L13	Q8N349	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FTMT	Q8N4E7	242 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	FGF11	Q92914	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MYDGF	Q969H8	173 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CFAP53	Q96M91	514 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	NRTN	Q99748	197 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A22	Q9H936	323 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	RAB20	Q9NX57	234 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	ASF1A	Q9Y294	204 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MEMO1	Q9Y316	297 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HIP1	O00291	1037 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	HCRTR1	O43613	425 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PFKFB2	O60825	505 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	STAMBP	O95630	424 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	AGT	P01019	485 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	INS	P01308	110 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	PNMT	P11086	282 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	MX1	P20591	662 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	COX5A	P20674	150 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-231	ENST00000477334	IMPDH1	P20839	514 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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