RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CDC20	Q12834	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CDH17	Q12864	832 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NRF1	Q16656	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HLA-B	Q31612	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	STARD8	Q92502	1023 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LITAF	Q99732	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GBA3	Q9H227	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SP140L	Q9H930	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	COL1A2	P08123	1366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563		K7EPI3	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CFLAR	O15519	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AQP9	O43315	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CACNG3	O60359	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ANXA9	O76027	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF432	O94892	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	NDUFA7	O95182	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	IGHE	P01854	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	AMBP	P02760	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	HEXB	P07686	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CD40LG	P29965	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FCGR2C	P31995	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	RFC2	P35250	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	MATK	P42679	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	LBX1	P52954	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PKNOX1	P55347	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GBE1	Q04446	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SPCS2	Q15005	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563		Q6ZSR9	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-227	ENST00000470563	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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