RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 METAP1P53582 386 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CAMK1Q14012 370 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C2orf27AQ580R0 203 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SHISA5Q8N114 240 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR6V1Q8N148 313 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR8S1Q8NH09 359 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 YIPF1Q9Y548 306 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 F5H5P2 479 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PRAF2O60831 178 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FABP1P07148 127 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SBK2P0C263 348 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF806P0C7X5 589 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NT5EP21589 574 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NUBP1P53384 320 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ST3GAL3Q11203 375 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HACD4Q5VWC8 232 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PELI1Q96FA3 418 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SGPP1Q9BX95 441 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SCN5AQ14524 2016 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 C4orf51C9J302 202 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 KLF4O43474 513 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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TPM3-215ENST00000469717 STARP49675 285 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PDX1P52945 283 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM219AQ8IW50 185 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SEC22AQ96IW7 307 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SPACA7Q96KW9 195 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR2AG1Q9H205 316 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 IL23AQ9NPF7 189 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TINAGQ9UJW2 476 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.32□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NDUFB6O95139 128 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 F3P13726 295 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 HPGDP15428 266 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 MC3RP41968 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 AKR1C3P42330 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 DLX5P56178 289 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 TGIF1Q15583 401 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 NAXDQ8IW45 347 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.31□□□□□ -1.24
TPM3-215ENST00000469717 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.31□□□□□ -1.24
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