RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC115Q96NT0 180 aa22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 CA10Q9NS85 328 aa22.98■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 B9A039 149 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 E9PBE3 544 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 KLF11O14901 512 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 ITM2AO43736 263 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 AKR7A3O95154 331 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 CRYAAP02489 173 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 CREB1P16220 341 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 IL7RP16871 459 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 OR7A5Q15622 319 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.97■■□□□ 1.27
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PBRM1-218ENST00000458294 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF440Q8IYI8 595 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 C3orf49Q96BT1 292 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
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PBRM1-218ENST00000458294 KRT33AO76009 404 aa22.96■■□□□ 1.27
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PBRM1-218ENST00000458294 S100A3P33764 101 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 CARTPTQ16568 116 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 GPAT4Q86UL3 456 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 OR1K1Q8NGR3 316 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.96■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.95■■□□□ 1.27
PBRM1-218ENST00000458294 OR6C65A6NJZ3 312 aa22.95■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF587BE7ETH6 402 aa22.95■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 SERPINE1P05121 402 aa22.95■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF23P17027 643 aa22.95■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.95■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.95■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 BPESC1Q9GZL8 116 aa22.94■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 PLK3Q9H4B4 646 aa22.94■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 CCDC154A6NI56 674 aa22.93■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 TGFAP01135 160 aa22.93■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 NR2F1P10589 423 aa22.93■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 CHI3L2Q15782 390 aa22.93■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.93■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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PBRM1-218ENST00000458294 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.92■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 BIRC5O15392 142 aa22.91■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 PGRP06401 933 aa22.91■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 CECR9P0C854 216 aa22.91■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PBRM1-218ENST00000458294 COPZ1P61923 177 aa22.91■■□□□ 1.26
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