RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF524	Q96C55	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MDFI	Q99750	246 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ABCD4	O14678	606 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PGM3	O95394	542 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PMS2P2	O95744	297 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ACVR1B	P36896	505 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SELPLG	Q14242	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MAPK14	Q16539	360 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FXYD1	O00168	92 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP5H	O75947	161 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	IFNA2	P01563	188 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ETFA	P13804	333 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PTAFR	P25105	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PGM1	P36871	562 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HTR3A	P46098	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DSTN	P60981	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	BNIP1	Q12981	228 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FADD	Q13158	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RGN	Q15493	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SYPL1	Q16563	259 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CD5L	O43866	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RAMP1	O60894	148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RAD51D	O75771	328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	THBS1	P07996	1170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC6A2	P23975	617 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MAGEA8	P43361	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RASSF2	P50749	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC7A2	P52569	658 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DSCR9	P59020	149 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PIF1	Q9H611	641 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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