RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM198Q66K66 360 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS9BPQ6ZS82 235 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 LUZP2Q86TE4 346 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNEQ86WN2 208 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB5Q8WWX0 329 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3R3Q92569 461 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARSGQ96EG1 525 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGLN2Q96KS0 407 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 VSTM2LQ96N03 204 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF681Q96N22 645 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFXN2Q96NB2 322 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD9Q96Q07 612 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPHQ9H3R5 247 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYNNQ9NPC7 610 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNIH4Q9P003 139 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRODH2Q9UF12 536 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FETUBQ9UGM5 382 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CR1P17927 2039 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTORP42345 2549 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCE1Q9P212 2302 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR91A4D1P6 747 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NNC1 897 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0YC42 278 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN4O14817 238 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AZIN1O14977 448 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOX3O15254 700 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN2O60636 221 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCN1O60741 890 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC22BO75396 215 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOXO94900 526 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZWINTO95229 277 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL1AP01583 271 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA8P0DM63 369 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT45A8P0DMV1 189 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT45A9P0DMV2 189 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UROSP10746 265 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP20933 346 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH3A1P30838 453 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSTR2P30874 369 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRB2P32121 409 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HPCAL1P37235 193 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 STARP49675 285 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASCL1P50553 236 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF136P52737 540 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLX5P56178 289 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 UFM1P61960 85 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCAN2Q14206 197 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGR1Q14914 329 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEPACAMQ14CZ8 416 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT71Q3SY84 523 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALG10Q5BKT4 473 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF626Q68DY1 528 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCA5Q86VQ0 697 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF614Q8N883 585 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5AK3PQ8NH89 298 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF675Q8TD23 568 aa3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 HGDQ93099 445 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms