RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PROX1Q92786 737 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A28Q96A46 364 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 EME1Q96AY2 570 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC115Q96NT0 180 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ALG9Q9H6U8 611 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ADA2Q9NZK5 511 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PCTPQ9UKL6 214 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS12A0PJE2 317 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR2A25A4D2G3 310 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SLC28A1O00337 649 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NME4O00746 187 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CLOCKO15516 846 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 AP2A2O94973 939 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OTCP00480 354 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 HPRP00739 348 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SOD3P08294 240 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TBXA2RP21731 343 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PSMB5P28074 263 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SOX3P41225 446 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PCYT1AP49585 367 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RHAGQ02094 409 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GGTLC2Q14390 218 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0040Q15053 153 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RAB35Q15286 201 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6KA2Q15349 733 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6AP1Q15904 470 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PFKFB4Q16877 469 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZBED5Q49AG3 693 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OPN5Q6U736 354 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SNX20Q7Z614 316 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 GPSM1Q86YR5 675 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SNX31Q8N9S9 440 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf49Q96BT1 292 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PHF21BQ96EK2 531 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 VMP1Q96GC9 406 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF479Q96JC4 524 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf30Q96M34 536 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR1F2PQ96R84 312 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NDNQ99608 321 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 DOK1Q99704 481 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CMTM6Q9NX76 183 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 A0A096LNT2 108 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 WWP2O00308 870 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PIP5K1BO14986 540 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD28O15084 1053 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 KPNA5O15131 536 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms