RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC17A1Q14916 467 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CDH24Q86UP0 819 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CDC20BQ86Y33 519 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 MCHR1Q99705 422 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ACTR6Q9GZN1 396 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM27Q9HBJ8 222 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ABCA4P78363 2273 aa13.22□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SPG11Q96JI7 2443 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 NME4O00746 187 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CASKO14936 926 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV3-9P01782 118 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CRYGSP22914 178 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 NUDT2P50583 147 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC7A2P52569 658 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 CDH12P55289 794 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 VEZF1Q14119 521 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 FAM91A1Q658Y4 838 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ULK3Q6PHR2 472 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 Q6ZT83 130 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 PIGWQ7Z7B1 504 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 MICU2Q8IYU8 434 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 OR2T12Q8NG77 320 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 MFSD8Q8NHS3 518 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 RNF217Q8TC41 542 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC38A4Q969I6 547 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 TAAR8Q969N4 342 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC25A36Q96CQ1 311 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 GPR52Q9Y2T5 361 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG1-202ENST00000370287 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.21□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CREBBPQ92793 2442 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 A0A087WUJ7 227 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GPR171O14626 319 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FMO6PO60774 539 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FZD7O75084 574 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LYZL6O75951 148 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LYPD3O95274 346 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PNMTP11086 282 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CBLP22681 906 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 IGHV1-2P23083 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PRDX6P30041 224 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LIPEQ05469 1076 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CASP12Q6UXS9 341 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 WDR88Q6ZMY6 472 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GPAT4Q86UL3 456 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZIC4Q8N9L1 334 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 OR9K2Q8NGE7 335 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 S100PBPQ96BU1 408 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FANCFQ9NPI8 374 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 AKAP6Q13023 2319 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GOSR1O95249 250 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 COX5AP20674 150 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 IL32P24001 234 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KDELR2P33947 212 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GSK3BP49841 420 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LTBQ06643 244 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ITGADQ13349 1161 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FAM69AQ5T7M9 428 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF613Q6PF04 617 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CARM1Q86X55 608 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KDM8Q8N371 416 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 APH1AQ96BI3 265 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CMTM5Q96DZ9 223 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PIK3IP1Q96FE7 263 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms