RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SLC17A1Q14916 467 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 ULK3Q6PHR2 472 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A4Q969I6 547 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A36Q96CQ1 311 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 MED18Q9BUE0 208 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 EMC3Q9P0I2 261 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 APCP25054 2843 aa23.9■■□□□ 1.42
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087WUJ7 227 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PPR1 153 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ELOVL7A1L3X0 281 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LYPD3O95274 346 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ADAP00813 363 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PRDX6P30041 224 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ENTPD8Q5MY95 495 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FAM91A1Q658Y4 838 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 TAAR8Q969N4 342 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CMTM5Q96DZ9 223 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SLC47A1Q96FL8 570 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ACTR6Q9GZN1 396 aa23.89■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FMO6PO60774 539 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 HRGP04196 525 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PNMTP11086 282 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CBLP22681 906 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 KDELR2P33947 212 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 GSK3BP49841 420 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD8Q8NHS3 518 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 EVA1AQ9H8M9 152 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SH3GLB1Q9Y371 365 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CSMD1Q96PZ7 3565 aa23.88■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB108AA8MXU0 73 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FZD7O75084 574 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PSME3P61289 254 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CARM1Q86X55 608 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CDC20BQ86Y33 519 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF100Q8IYN0 542 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 OR9K2Q8NGE7 335 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 S100PBPQ96BU1 408 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LIME1Q9H400 295 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ARL8BQ9NVJ2 186 aa23.87■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 GPR171O14626 319 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 OR1E2P47887 323 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LTBQ06643 244 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF613Q6PF04 617 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CASP12Q6UXS9 341 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZT83 130 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 GPAT4Q86UL3 456 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 KDM8Q8N371 416 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PROX1Q92786 737 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 APH1AQ96BI3 265 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ALG2Q9H553 416 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ABCD2Q9UBJ2 740 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.86■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LRRN3E7EW58 273 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CASKO14936 926 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LYZL6O75951 148 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CRYGSP22914 178 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV1-2P23083 117 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SFRP5Q5T4F7 317 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FAM69AQ5T7M9 428 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 RASSF5Q8WWW0 418 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHAC1Q9H158 963 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SELENONQ9NZV5 590 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa23.85■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 M0R082 166 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CHP2O43745 196 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 GRPRP30550 384 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CDH24Q86UP0 819 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF417Q8TAU3 575 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 MOGAT1Q96PD6 335 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 BAG5Q9UL15 447 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A7Q9UM01 511 aa23.84■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 AP3M1Q9Y2T2 418 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms