RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf51A8MQB3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LEUTXA8MZ59 168 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf74A8MZ97 194 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 H7C1C5 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OGG1O15527 345 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OIP5O43482 229 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SSNA1O43805 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 UBL3O95164 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NDUFB2O95178 105 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GPANK1O95872 356 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA3P12429 323 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SPI1P17947 270 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MAOAP21397 527 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GDNFP39905 211 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TNFRSF4P43489 277 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SOX2P48431 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SELENOPP49908 381 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PER3P56645 1201 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LCN6P62502 163 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SIRPAP78324 504 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PLA2G7Q13093 441 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 POU4F3Q15319 338 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GSG1Q2KHT4 349 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ODF4Q2M2E3 257 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CDONQ4KMG0 1287 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZSR6 202 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZTK2 550 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RNF44Q7L0R7 432 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF511Q8NB15 262 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR52I2Q8NH67 350 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SGTBQ96EQ0 304 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GPR137Q96N19 417 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GABRG3Q99928 467 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CHIAQ9BZP6 476 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR10A4Q9H209 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ING4Q9UNL4 249 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 GPR171O14626 319 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FOXS1O43638 330 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SCO1O75880 301 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FCER2P06734 321 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 UCHL1P09936 223 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T7P0C7T2 308 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CD53P19397 219 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ENPP1P22413 925 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 VEGFCP49767 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CCR4P51679 360 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RAB38P57729 211 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KCNAB1Q14722 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 LEG1Q6P5S2 330 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 FCRLAQ7L513 359 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 PARGQ86W56 976 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR8H3Q8N146 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T4Q8NH00 348 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T27Q8NH04 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CEP76Q8TAP6 659 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 RIT1Q92963 219 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF524Q96C55 264 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 Q96M85 177 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 VSTM2LQ96N03 204 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM2Q9C040 744 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 EMC7Q9NPA0 242 aa6.66□□□□□ -1.34
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