RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
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PACSIN3-201ENST00000298838 HPNP05981 417 aa18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPAN19P0C672 248 aa18.67■□□□□ 0.58
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PACSIN3-201ENST00000298838 OR7A5Q15622 319 aa18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
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PACSIN3-201ENST00000298838 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC22A16Q86VW1 577 aa18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEANCQ8N8B7 351 aa18.67■□□□□ 0.58
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PACSIN3-201ENST00000298838 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
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PACSIN3-201ENST00000298838 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.67■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 LIPT2A6NK58 231 aa18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 GJE1A6NN92 205 aa18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM166BA8MTA8 275 aa18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MCIDASD6RGH6 385 aa18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOT7O00154 380 aa18.66■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKYO43930 277 aa18.66■□□□□ 0.58
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