RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 ECH1Q13011 328 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 C4orf17Q53FE4 359 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 Q6ZTK2 550 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 LMF1Q96S06 567 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GAB2Q9UQC2 676 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PRAMEF11O60813 436 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CKMP06732 381 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 MC3RP41968 323 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR10A3P58181 314 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ENPP2Q13822 863 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR7A5Q15622 319 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GXYLT1Q4G148 440 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CERKQ8TCT0 537 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 RAB24Q969Q5 203 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 HHIPQ96QV1 700 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SIGLEC5O15389 551 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 KCNQ2O43526 872 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PAPLNO95428 1278 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR4E1P0C645 316 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PTNP21246 168 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CLDN12P56749 244 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 KLHL15Q96M94 604 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 BRF2Q9HAW0 419 aa11.99□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CLN5O75503 358 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 HBQ1P09105 142 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 NFYBP25208 207 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 VAMP3Q15836 100 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 EDAQ92838 391 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GLYATL1Q969I3 302 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 LNP1A1A4G5 178 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SLC16A8O95907 504 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CHRM4P08173 479 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 AMY2BP19961 511 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SGSHP51688 502 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OPN5Q6U736 354 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GPR20Q99678 358 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 H7C4K7 107 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 UGDHO60701 494 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 JTBO76095 146 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 YIF1AO95070 293 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 POMCP01189 267 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 HPXP02790 462 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CALCBP10092 127 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 TACR1P25103 407 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 GALNT16Q8N428 558 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CLCC1Q96S66 551 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 MPC1LP0DKB6 136 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 NDUFB7P17568 137 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 SOX18P35713 384 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ACVRL1P37023 503 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 AWAT1Q58HT5 328 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 NEK7Q8TDX7 302 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 CMKLR1Q99788 373 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 FAM183AA6NL82 134 aa11.97□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 OR2AG2A6NM03 316 aa11.97□□□□□ -0.49
VAMP4-201ENST00000236192 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms