RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SLC19A2O60779 497 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ATP1B1P05026 303 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TMEM225BP0DP42 221 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GPX2P18283 190 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CELP19835 753 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ATP1B3P54709 279 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 KEAP1Q14145 624 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NKG7Q16617 165 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PLET1Q6UQ28 207 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR2A5Q96R48 311 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C12orf49Q9H741 205 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FUOMA2VDF0 154 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GREM1O60565 184 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ICOSLGO75144 302 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RAB3AP20336 220 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 HOXA6P31267 233 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PLA2G5P39877 138 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MEOX1P50221 254 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PUDPQ08623 228 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PERM1Q5SV97 790 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PDSS2Q86YH6 399 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SAP25Q8TEE9 199 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 VNN3Q9NY84 501 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RNF6Q9Y252 685 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TRIP11Q15643 1979 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPH5 198 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF195O14628 629 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SNPHO15079 494 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TNFRSF21O75509 655 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 IFNA21P01568 189 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ARR3P36575 388 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 VASNQ6EMK4 673 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR8K3Q8NH51 312 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SLC35A4Q96G79 324 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GINS4Q9BRT9 223 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RAB33BQ9H082 229 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF639Q9UID6 485 aa7.35□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPE2 198 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PR64 198 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PRV1 198 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SPINT1O43278 529 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TBX19O60806 448 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FZD7O75084 574 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ATG12O94817 140 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RAB11BQ15907 218 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GPR148Q8TDV2 347 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MED18Q9BUE0 208 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NUDT9Q9BW91 350 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ING3Q9NXR8 418 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SNAP29O95721 258 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RLN2P04090 185 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CEACAM1P13688 526 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GABRA1P14867 456 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 KLBQ86Z14 1044 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GIMAP5Q96F15 307 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CSF3RQ99062 836 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1B0GVG6 124 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CDRT1O95170 752 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DIRAS3O95661 229 aa7.34□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms