RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 LGALS3BPQ08380 585 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 BEST3Q8N1M1 668 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 STRADBQ9C0K7 418 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 FAM166BA8MTA8 275 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SURF4O15260 269 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 YKT6O15498 198 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SUSD5O60279 629 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SELENOFO60613 162 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC159P0C7I6 412 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CELP19835 753 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ACVR1BP36896 505 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 MTNR1AP48039 350 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ITGADQ13349 1161 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 DNASE1L3Q13609 305 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM205Q6UW68 189 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 HSD17B8Q92506 261 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SGTBQ96EQ0 304 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 MGLLQ99685 303 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 DEPPQ9NTK1 212 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GVC2 190 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM72A0PK05 275 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 A6NIN4 97 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PRR33A8MZF0 331 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ALG1L2C9J202 215 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 KLF4O43474 513 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A12O75746 678 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SDHBP21912 280 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 FPR3P25089 353 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PMP22Q01453 160 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF550Q7Z398 422 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ASB15Q8WXK1 588 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR5B2Q96R09 309 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 BHLHE40O14503 412 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ITGB2P05107 769 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CDK1P06493 297 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 MSL3P1P0C860 447 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SLC1A3P43003 542 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ZBED5Q49AG3 693 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RAET1LQ5VY80 246 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf73Q69YU5 71 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 LEG1Q6P5S2 330 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 KLBQ86Z14 1044 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 UCN2Q96RP3 112 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TMED9Q9BVK6 235 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OCEL1Q9H607 264 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 MMP25Q9NPA2 562 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA1DQ01668 2161 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 LRRK2Q5S007 2527 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RNF13O43567 381 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 AK1P00568 194 aa5.95□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms