RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hpf1Q8CFE2 346 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 MepeQ8K4L6 441 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r215Q8R264 300 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uckl1Q91YL3 548 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Entpd4Q9DBT4 613 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrit3W8DXL4 681 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 MiipA2A7Y5 387 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2abC0HKE1 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2acC0HKE2 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2adC0HKE3 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2agC0HKE5 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2anC0HKE7 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2apC0HKE9 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10608E9PZ13 166 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 LynP25911 512 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gstm5P48774 224 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps7P62082 194 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fv1P70213 459 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 UbqlnlQ14DL0 610 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctsll3Q3ULP7 331 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC030870Q3V2G4 71 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fkbp10Q61576 581 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ckmt2Q6P8J7 419 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eid2Q6X7S9 236 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr171Q8BG55 319 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem163Q8C996 288 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Faim2Q8K097 317 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srpx2Q8R054 468 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2afjQ8R1M2 129 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frs3Q91WJ0 492 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dusp7Q91Z46 422 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubqln4Q99NB8 596 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lyzl6Q9DA11 148 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fank1Q9DAM9 344 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn14Q9Z0S3 239 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med13Q5SWW4 2171 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 AgrnA2ASQ1 1950 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdia2D3Z6P0 527 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cops4O88544 406 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsd3b3P26150 373 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou3f4P62515 361 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gcnt7Q3V3K7 433 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 BocQ6AZB0 1110 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtch2Q791V5 303 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc39Q8BGI7 337 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Coro2aQ8C0P5 524 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plac9Q8K262 108 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 BmfQ91ZE9 185 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tssk6Q925K9 273 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr89Q9D0R9 386 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem25Q9DCF1 365 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chrm3Q9ERZ3 589 aa10.76□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Heatr5bQ8C547 2070 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ms4a7E9Q9V5 267 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 FstP47931 344 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Opn5Q6VZZ7 377 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vgll4Q80V24 287 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts4Q8BNJ2 833 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clic5Q8BXK9 251 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr572Q8VGZ3 318 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asb16Q8VHS5 453 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 HypmQ9CR04 117 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc10a6Q9CXB2 373 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slco1b2Q9JJL3 689 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dok3Q9QZK7 444 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 TapbpQ9R233 465 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col6a6Q8C6K9 2265 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr750E9Q0Z1 331 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 F10O88947 481 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01808 119 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 TP20293 436 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa10P31310 416 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 S100gP97816 79 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem181aQ3U3W2 474 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taar6Q5QD13 345 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam9Q61072 845 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prtn3Q61096 254 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zrsr1Q64707 428 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hs6st2Q80UW0 612 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnk10Q8BUW1 535 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9a8Q8R4D1 576 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr668Q8VGW3 318 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 NansQ99J77 359 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 2610042L04RikQ9D073 150 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 Obp1aQ9D3H2 163 aa10.75□□□□□ -0.69
Herc3-201ENSMUST00000031823 PmpcaQ9DC61 524 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms