RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	RIM4	P38741	713 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	TDA6	Q06466	467 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	HIF1	Q12373	385 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	HIS5	P07172	385 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	WHI2	P12611	486 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	COY1	P34237	679 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	CCL1	P37366	393 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	PEX19	Q07418	342 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	RIM20	Q12033	661 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	PIN2	Q12057	282 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	MCM1	P11746	286 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	PEX2	P32800	271 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	HFI1	Q12060	488 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SYF2	YGR129W	CIT1	P00890	479 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SPE1	P08432	466 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	IMP2'	P32351	346 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	EAF5	P39995	279 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	LAM5	P43560	674 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YML053C	Q04978	212 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	COQ9	Q05779	260 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	EST2	Q06163	884 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	NSE1	Q07913	336 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YOR022C	Q12204	715 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	TSC13	Q99190	310 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	HMG2	P12684	1045 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.57	□□□□□ -1.36	not detected
SYF2	YGR129W	SGF29	P25554	259 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RAD27	P26793	382 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YTA6	P40328	754 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YGL081W	P53156	320 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YNL165W	P53891	406 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RLF2	Q12495	606 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	not detected
SYF2	YGR129W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	TMT1	P32643	299 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	VID28	P40547	921 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ZAP1	P47043	880 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SFB2	P53953	876 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YMR187C	Q03236	431 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	YML083C	Q04526	418 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SMC5	Q08204	1093 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	MLF3	P32047	452 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PEP12	P32854	288 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ESC8	Q08119	714 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	MSB2	P32334	1306 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CYT1	P07143	309 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CLN3	P13365	580 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RXT2	P38255	430 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	FMO1	P38866	432 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	KTR7	P40504	517 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	LSB6	P42951	607 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	TAM41	P53230	385 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ENV11	P53246	860 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	DIP5	P53388	608 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	ROD1	Q02805	837 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	AIM33	Q04516	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PLP2	Q12017	286 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	LAA1	P39526	2014 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	GLN3	P18494	730 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	PEP3	P27801	918 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SKN7	P38889	622 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	FIS1	P40515	155 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	TPO2	P53283	614 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	NKP2	Q06162	153 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SYF2	YGR129W	RAD50	P12753	1312 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SYF2	YGR129W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SYF2	YGR129W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37

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