RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	TEP1	P53916	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	MDM38	Q08179	573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	DIF1	O13577	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	DAL7	P21826	554 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SDS22	P36047	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	PSY4	P38193	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	HXT7	P39004	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YKE2	P52553	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NPY1	P53164	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NSG2	P53898	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	FUN30	P31380	1131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NGG1	P32494	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	BEM3	P32873	1128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	XRS2	P33301	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	MDJ1	P35191	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	OAF3	P36023	863 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ALG14	P38242	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	GPB2	P39717	880 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SAW1	P39735	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RRT14	P40470	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SHR5	P41912	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ASK10	P48361	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ENV11	P53246	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	DSE4	P53753	1117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SPS1	P08458	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SEC65	P29478	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YSC84	P32793	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SAP190	P36123	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ESL1	P40456	1118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YFL052W	P43551	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	HXT16	P47185	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	TAD1	P53065	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	GTR1	Q00582	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SRT1	Q03175	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	HIM1	Q06674	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
HTA2	YBL003C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	COQ4	O13525	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	MTC3	P53077	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	OSW2	Q12202	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NHA1	Q99271	985 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	BI4	P03879	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	MRP7	P12687	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SEG2	P34250	1132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	PEX5	P35056	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YKR075C	P36155	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	PIK1	P39104	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	TED1	P40533	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	VTC2	P43585	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YJL045W	P47052	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	MEP3	P53390	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	GIS4	Q04233	774 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	TDA6	Q06466	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ARP7	Q12406	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ENT1	Q12518	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTA2	YBL003C	ERS1	P17261	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	OPI1	P21957	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	MIH1	P23748	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SWI3	P32591	825 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YKR018C	P36114	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	TAF5	P38129	798 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CCZ1	P38273	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	GIC1	P38785	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YIL092W	P40497	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SMK1	P41808	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ERR3	P42222	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ZIP2	P53061	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	TIM50	Q02776	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	HLR1	Q04429	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CRR1	Q05790	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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