RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 FLIIQ13045 1269 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC51AQ86UW1 340 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 FZD9O00144 591 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF521Q96K83 1311 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 CCER2I3L3R5 266 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 MPNDQ8N594 471 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 VPS33BQ9H267 617 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 IGKV5-2P06315 115 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 PPIP5K2O43314 1243 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 PDE8AO60658 829 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 APLP1P51693 650 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 NIM1KQ8IY84 436 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SLC35A3-211ENST00000638876 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.76■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.76■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 GPC2Q8N158 579 aa27.75■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 AOC3Q16853 763 aa27.74■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 COL4A5P29400 1685 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 CACNA1FO60840 1977 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 E9PSI1 815 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 LINS1Q8NG48 757 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 HACL1Q9UJ83 578 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.71■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 TAF1P21675 1872 aa27.7■■■□□ 2.03
SLC35A3-211ENST00000638876 GCKRQ14397 625 aa27.7■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 H7C1W4 665 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 CTSWP56202 376 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 SCN4AP35499 1836 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 CHADLQ6NUI6 762 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 EPHX2P34913 555 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 GPSM2P81274 684 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 LDHDQ86WU2 507 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 F6X3S4 739 aa27.65■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 C6orf229H3BNL8 230 aa27.65■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 SLFN5Q08AF3 891 aa27.65■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 WASHC4Q2M389 1173 aa27.65■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 POTEIP0CG38 1075 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 POTEJP0CG39 1038 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 EYA3Q99504 573 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 COL4A1P02462 1669 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC35A3-211ENST00000638876 CXCL9Q07325 125 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 POLLQ9UGP5 575 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 BEND3Q5T5X7 828 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 GREM2Q9H772 168 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 RTL9Q8NET4 1388 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 CASP7P55210 303 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 RIMBP2O15034 1052 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 SCNN1DP51172 638 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 TNIP1Q15025 636 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 GGA1Q9UJY5 639 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 UFL1O94874 794 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 RAD17O75943 681 aa27.58■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
SLC35A3-211ENST00000638876 YDJCA8MPS7 323 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 EPS15P42566 896 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 HTRA3P83110 453 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.57■■■□□ 2
SLC35A3-211ENST00000638876 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms