RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627074.2

PCBP1-AS1-308, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 871 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NFKBIE	O00221	500 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NTSR2	O95665	410 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HOXB7	P09629	217 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GNAI1	P63096	354 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CCDC27	Q2M243	656 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ERFE	Q4G0M1	354 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TSPYL6	Q8N831	410 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	9.91	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C21orf2	O43822	256 aa		9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	STYK1	Q6J9G0	422 aa		9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MASTL	Q96GX5	879 aa		9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		9.9	□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SNED1	Q8TER0	1413 aa		9.9	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NPHP1	O15259	732 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CRY2	Q49AN0	593 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	OLFM4	Q6UX06	510 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC51A	Q86UW1	340 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SYNE4	Q8N205	404 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF428	Q96B54	188 aa		9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MYH3	P11055	1940 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NPR1	P16066	1061 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TCIRG1	Q13488	830 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NLRP10	Q86W26	655 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CNKSR1	Q969H4	720 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NYX	Q9GZU5	481 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RNF181	Q9P0P0	153 aa		9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPEF2	Q9C093	1822 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KIF3C	O14782	793 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C1QTNF8	P60827	252 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	WDR90	Q96KV7	1748 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	COL4A5	P29400	1685 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IL16	Q14005	1332 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DPYSL4	O14531	572 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LMNB1	P20700	586 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DSG2	Q14126	1118 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PARP10	Q53GL7	1025 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HYPK	Q9NX55	129 aa		9.86	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LTBP1	Q14766	1721 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF521	Q96K83	1311 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	G2E3	Q7L622	706 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	WDR63	Q8IWG1	891 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ALDH1B1	P30837	517 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FOXK1	P85037	733 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CCDC93	Q567U6	631 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MICALL2	Q8IY33	904 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SCN4A	P35499	1836 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCC4	O15439	1325 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	POTEC	B2RU33	542 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	VAMP4	O75379	141 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		9.82	□□□□□ -0.84

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