RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CSAG3-202ENST00000617158 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.14■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 TAF1P21675 1872 aa26.13■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 SRGAP3O43295 1099 aa26.13■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 FAM161AQ3B820 660 aa26.13■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 GREM2Q9H772 168 aa26.13■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 PTGER2P43116 358 aa26.12■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 RTL9Q8NET4 1388 aa26.11■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.1■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 ST5P78524 1137 aa26.1■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.1■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.1■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.09■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP3Q96P20 1036 aa26.09■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.09■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.09■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 CRY2Q49AN0 593 aa26.08■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 DCTPP1Q9H773 170 aa26.08■■□□□ 1.77
CSAG3-202ENST00000617158 LRP5O75197 1615 aa26.07■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.07■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 NPHP1O15259 732 aa26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 ITGA6P23229 1130 aa26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 SMC5Q8IY18 1101 aa26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 COPRSQ9NQ92 184 aa26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 SPEF2Q9C093 1822 aa26.05■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 HMMRO75330 724 aa26.05■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.05■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.03■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.02■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.02■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.02■■□□□ 1.76
CSAG3-202ENST00000617158 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 SRGNP10124 158 aa26.01■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 DLEC1Q9Y238 1755 aa26■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 POLD1P28340 1107 aa26■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC24Q50LG9 513 aa26■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 SLC51AQ86UW1 340 aa26■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 PDE6BP35913 854 aa25.99■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 SIL1Q9H173 461 aa25.99■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 SASH1O94885 1247 aa25.98■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 GCC1Q96CN9 775 aa25.98■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 SPON1Q9HCB6 807 aa25.98■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GUL6 1792 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 EYA2O00167 538 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 CHRNA5P30532 468 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.97■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.96■■□□□ 1.75
CSAG3-202ENST00000617158 CIAO1O76071 339 aa25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 NPR1P16066 1061 aa25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 KCNA3P22001 575 aa25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 GRAPQ13588 217 aa25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 CACNA1SQ13698 1873 aa25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 SKAP1Q86WV1 359 aa25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.94■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 APBB1O00213 710 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 NUCB1Q02818 461 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 MASTLQ96GX5 879 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO3Q9UK99 471 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 SLX4Q8IY92 1834 aa25.93■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 RAB11FIP3O75154 756 aa25.92■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 STYK1Q6J9G0 422 aa25.92■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 H0YIN7 160 aa25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 DPEP1P16444 411 aa25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0G2JLW4 131 aa25.9■■□□□ 1.74
CSAG3-202ENST00000617158 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms