RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDK19Q9BWU1 502 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PXDNQ92626 1479 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 DLC1Q96QB1 1528 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM13AO94988 1023 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP4Q13107 963 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 DPH6Q7L8W6 267 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 HELQQ8TDG4 1101 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM161BQ96MY7 647 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF20Q5VTR2 975 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 MRS2Q9HD23 443 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TNS4Q8IZW8 715 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGEF10O15013 1369 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 NDUFB5O43674 189 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAPK8P45983 427 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PARP2Q9UGN5 583 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF1AQ12756 1690 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 SBNO1A3KN83 1393 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD62A6NC57 917 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNPHO15079 494 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 APLP1P51693 650 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP4CP60510 307 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 MSS51Q4VC12 460 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATRNO75882 1429 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TONSLQ96HA7 1378 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TREHO43280 583 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 MPSTP25325 297 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 BAG6P46379 1132 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLCB3Q01970 1234 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 AAMPQ13685 434 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGERQ15109 404 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAPN10Q9HC96 672 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4DIP-241ENST00000616206 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A0G2JS52 829 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 M0R2N6 131 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPR3P17342 541 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYT1Q01538 1121 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL26A1Q96A83 441 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPSB2Q99619 263 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF19AQ9NV58 838 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADGRB2O60241 1585 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACEP12821 1306 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM83GA6ND36 823 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 MMP16P51512 607 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERFEQ4G0M1 354 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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PDE4DIP-241ENST00000616206 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 EVC2Q86UK5 1308 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP32Q8NFA0 1604 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 SORBS3O60504 671 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSPA6P17066 643 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4DIP-241ENST00000616206 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
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