RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 LRRC24Q50LG9 513 aa16.68■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF609O15014 1411 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 KCNQ2O43526 872 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 ITPK1Q13572 414 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 IL27Q8NEV9 243 aa16.67■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 MCM2P49736 904 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 USP21Q9UK80 565 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 HAUS7Q99871 368 aa16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 SYNE4Q8N205 404 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 UBN2Q6ZU65 1347 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 FAM227BQ96M60 508 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 SNRKQ9NRH2 765 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-221ENST00000597512 CTSWP56202 376 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 TIMM10P62072 90 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.64■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PTH1RQ03431 593 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CERKQ8TCT0 537 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1B0GUL7 405 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PDE8AO60658 829 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 BCORQ6W2J9 1755 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 A0A0D9SFI3 127 aa16.63■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 SPEF2Q9C093 1822 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CAMTA2O94983 1202 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 ITGA6P23229 1130 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 GREM2Q9H772 168 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 MED23Q9ULK4 1368 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 AK7Q96M32 723 aa16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 NHSQ6T4R5 1651 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 BTAF1O14981 1849 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 MCM4P33991 863 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 RASEFQ8IZ41 740 aa16.61■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 TMX3Q96JJ7 454 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PARP10Q53GL7 1025 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 SUSD4Q5VX71 490 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 MAP4K1Q92918 833 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 KCNB2Q92953 911 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 LAMB2P55268 1798 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.6■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 NECTIN1Q15223 517 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 TICAM2Q86XR7 235 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 KCNJ4P48050 445 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 LRP5O75197 1615 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 GOLIM4O00461 696 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 METTL24Q5JXM2 366 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 XAGE2Q96GT9 111 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.58■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 NUCB2P80303 420 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 CUL4AQ13619 759 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 GORABQ5T7V8 394 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 GBP4Q96PP9 640 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.57■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 HSPA1LP34931 641 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-221ENST00000597512 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms