RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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HERC3-212ENST00000597259 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 GGA1Q9UJY5 639 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-212ENST00000597259 ADGRB3O60242 1522 aa8.28□□□□□ -1.08
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HERC3-212ENST00000597259 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-212ENST00000597259 ROCK1Q13464 1354 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-212ENST00000597259 IRF5Q13568 498 aa8.26□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.25□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.25□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 NWD1Q149M9 1564 aa8.24□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 ABL2P42684 1182 aa8.24□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 HCN2Q9UL51 889 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-212ENST00000597259 COG6Q9Y2V7 657 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-212ENST00000597259 KANK1Q14678 1352 aa8.23□□□□□ -1.09
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HERC3-212ENST00000597259 VAC14Q08AM6 782 aa8.2□□□□□ -1.1
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HERC3-212ENST00000597259 Q8N3U1 123 aa8.2□□□□□ -1.1
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HERC3-212ENST00000597259 CLTCL1P53675 1640 aa8.19□□□□□ -1.1
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HERC3-212ENST00000597259 CD33P20138 364 aa8.19□□□□□ -1.1
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HERC3-212ENST00000597259 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 INHAP05111 366 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 AIDAQ96BJ3 306 aa8.18□□□□□ -1.1
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HERC3-212ENST00000597259 ITGAEP38570 1179 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 CHSY3Q70JA7 882 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 USP3Q9Y6I4 520 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 NUP155O75694 1391 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 A0A1W2PNR3 127 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 KCNA6P17658 529 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 ITGB7P26010 798 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 SMTNP53814 917 aa8.16□□□□□ -1.1
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