RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 LRMPQ12912 555 aa13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 COL18A1P39060 1754 aa13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 KSR2Q6VAB6 950 aa13.69□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC192P0DO97 292 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 FERMT3Q86UX7 667 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 MTMR6Q9Y217 621 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CYP27B1O15528 508 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 AOX1Q06278 1338 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.68□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 GRM8O00222 908 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 IGKV5-2P06315 115 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 LUZP1Q86V48 1076 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 A0A0D9SFI3 127 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 GJB2P29033 226 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ST3GAL1Q11201 340 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 MYD88Q99836 296 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.67□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 SMTNL1A8MU46 457 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 STK3Q13188 491 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 SYCP1Q15431 976 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 KLHL34Q8N239 644 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PPFIA3O75145 1194 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 COPS6Q7L5N1 327 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 HYPKQ9NX55 129 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 NCAPD2Q15021 1401 aa13.66□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 TNNT1P13805 278 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PHKG2P15735 406 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 PDIA6Q15084 440 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 CAMK4Q16566 473 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ME3Q16798 604 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 USP16Q9Y5T5 823 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 TYRO3Q06418 890 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 FSD1Q9BTV5 496 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 HOXB7P09629 217 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 SLFN14P0C7P3 912 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 LIG1P18858 919 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
FCHO1-218ENST00000596951 TTC6Q86TZ1 520 aa13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 MAP3K11Q16584 847 aa13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CBX8Q9HC52 389 aa13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.64□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF790Q6PG37 636 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 DRC7Q8IY82 874 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 LINS1Q8NG48 757 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 TMEM51Q9NW97 253 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CACNA1FO60840 1977 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 FOSBP53539 338 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 TAF3Q5VWG9 929 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 MTX1Q13505 466 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.62□□□□□ -0.23
FCHO1-218ENST00000596951 IFNL2Q8IZJ0 200 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms