RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NPR1P16066 1061 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 GLTPD2A6NH11 291 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 G2E3Q7L622 706 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MEIS3Q99687 375 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 GNAI2P04899 355 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A3P48751 1232 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP98P52948 1817 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SOGA3Q5TF21 947 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NYXQ9GZU5 481 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC45O75419 566 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PROSER3Q2NL68 480 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC12Q96J65 1359 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CRY2Q49AN0 593 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 GPTP24298 496 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ERFEQ4G0M1 354 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SUSD4Q5VX71 490 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA1P04083 346 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NFKBIBQ15653 356 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX21Q969T3 373 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D2Q9BYX2 928 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC22Q5TAA0 569 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 POTECB2RU33 542 aa31.26■■■□□ 2.6
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CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL3Q9H4L5 887 aa31.26■■■□□ 2.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NTSR2O95665 410 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC93Q567U6 631 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA1SQ13698 1873 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 F6X3S4 739 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFM4Q6UX06 510 aa31.24■■■□□ 2.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 NECTIN2Q92692 538 aa31.23■■■□□ 2.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP10Q53GL7 1025 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SNED1Q8TER0 1413 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR90Q96KV7 1748 aa31.19■■■□□ 2.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CASC1Q6TDU7 716 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 HSCBQ8IWL3 235 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SMC1BQ8NDV3 1235 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-204ENST00000587718 AOX1Q06278 1338 aa31.14■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP10Q86W26 655 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 USP44Q9H0E7 712 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNE4Q8N205 404 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP3Q96P20 1036 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD1Q99460 953 aa31.12■■■□□ 2.57
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