RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	ELN	P15502	786 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	DOC2B	Q14184	412 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf172	C9J069	976 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	RARA	P10276	462 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	COL26A1	Q96A83	441 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	EGFR	P00533	1210 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	GPLD1	P80108	840 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	GRIK4	Q16099	956 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	PRMT3	O60678	531 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	CPB1	P15086	417 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	OCLN	Q16625	522 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	COX20	Q5RI15	118 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PTPRM-215	ENST00000583289	OPLAH	O14841	1288 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SASH3	O75995	380 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG7	O95352	703 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	NRL	P54845	237 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf46	Q6P387	395 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC9	Q92623	222 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	XYLB	O75191	536 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PLAUR	Q03405	335 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ILDR2	Q71H61	639 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	EEA1	Q15075	1411 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PSAP	P07602	524 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SELP	P16109	830 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SOX18	P35713	384 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	GRIK5	Q16478	980 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	USP21	Q9UK80	565 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	DYRK3	O43781	588 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	GHRH	P01286	108 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGB7	P26010	798 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCA2	P51531	1590 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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