RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709	CHD4	Q14839	1912 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	GRAP	Q13588	217 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	SOGA3	Q5TF21	947 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	TAF1	P21675	1872 aa		29.96	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	BBOX1	O75936	387 aa		29.95	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.95	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
ERBB2-209	ENST00000578709	RTL9	Q8NET4	1388 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	TNN	Q9UQP3	1299 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CSF1R	P07333	972 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	FOXO4	P98177	505 aa		29.92	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC93	Q567U6	631 aa		29.92	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		29.92	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	COL4A1	P02462	1669 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	SNED1	Q8TER0	1413 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	OLFM4	Q6UX06	510 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	TMC4	Q7Z404	712 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	NFKBIE	O00221	500 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	GREM2	Q9H772	168 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	SUCLG2	Q96I99	432 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ERBB2-209	ENST00000578709	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	SP8	Q8IXZ3	490 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	SBF1	O95248	1867 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	RASSF7	Q02833	373 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM161A	Q3B820	660 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	SLC51A	Q86UW1	340 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	RLBP1	P12271	317 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	ITGA6	P23229	1130 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	29.83	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	PSMD1	Q99460	953 aa		29.83	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
ERBB2-209	ENST00000578709	LMNB1	P20700	586 aa		29.82	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	PRELP	P51888	382 aa		29.82	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		29.82	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	MEIS3	Q99687	375 aa		29.82	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	MS4A1	P11836	297 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	GNAI3	P08754	354 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		29.79	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	PLIN1	O60240	522 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	MPND	Q8N594	471 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	RNF181	Q9P0P0	153 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	SPEF2	Q9C093	1822 aa		29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ERBB2-209	ENST00000578709	YY1	P25490	414 aa		29.76	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	LTBP1	Q14766	1721 aa		29.76	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.75	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	GPSM2	P81274	684 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	PDE3A	Q14432	1141 aa		29.72	■■■□□ 2.35

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