RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRMP28827 1452 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA3Q08378 1498 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 INPP5BP32019 993 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 USP5P45974 858 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 IDH3AP50213 366 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PDE3BQ13370 1112 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 TMC1Q8TDI8 760 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GPR152Q8TDT2 470 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 IQGAP2Q13576 1575 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 MAN1A2O60476 641 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 NLRP8Q86W28 1048 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 RUBCNLQ9H714 662 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GPAMQ9HCL2 828 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35F4A4IF30 521 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 SOBPA7XYQ1 873 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 THBS1P07996 1170 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 ARSDP51689 593 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PLCB3Q01970 1234 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 EHHADHQ08426 723 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PCSK2P16519 638 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PTSQ03393 145 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 TYRO3Q06418 890 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 DISP1Q96F81 1524 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 XKR5Q6UX68 686 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PGBD3Q8N328 593 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 USP20Q9Y2K6 914 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 NEO1Q92859 1461 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-208ENST00000578600 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 KIFC2Q96AC6 838 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM47Q96LD4 638 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 SENP2Q9HC62 589 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 A6NHS1 94 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CEP63Q96MT8 703 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 EGFRP00533 1210 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 KCNQ4P56696 695 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 FGD1P98174 961 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf34Q49A92 452 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 EFHC2Q5JST6 749 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 EFSO43281 561 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 FAM157BP0CG42 384 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 VAMP1P23763 118 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 MAPK8P45983 427 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 DBN1Q16643 649 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 BRD7Q9NPI1 651 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 LCE2BO14633 110 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 RAPGEF3O95398 923 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TCF3P15923 654 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 EPB42P16452 691 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ORC1Q13415 861 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 CSRNP1Q96S65 589 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 HCN2Q9UL51 889 aa8.42□□□□□ -1.06
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