RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 PDE8AO60658 829 aa27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
RNPS1-218ENST00000566180 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 MIER1Q8N108 512 aa27.26■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 POTECB2RU33 542 aa27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 FZD9O00144 591 aa27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 LINS1Q8NG48 757 aa27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 JDP2Q8WYK2 163 aa27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 H7C1W4 665 aa27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 MPNDQ8N594 471 aa27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 VPS33BQ9H267 617 aa27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 LAMB2P55268 1798 aa27.23■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 GCKRQ14397 625 aa27.23■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.23■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.23■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.22■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.21■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 F6X3S4 739 aa27.21■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.21■■□□□ 1.95
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.2■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 PPIP5K2O43314 1243 aa27.19■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 CTSWP56202 376 aa27.19■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 BEND3Q5T5X7 828 aa27.19■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.19■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 HSPA6P17066 643 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 CASP7P55210 303 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 AOC3Q16853 763 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 FSTL1Q12841 308 aa27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 NIM1KQ8IY84 436 aa27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 COL4A5P29400 1685 aa27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 WDR90Q96KV7 1748 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 GPC2Q8N158 579 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 COL4A1P02462 1669 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 GPSM2P81274 684 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.13■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 GREM2Q9H772 168 aa27.13■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 RTL9Q8NET4 1388 aa27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 POLLQ9UGP5 575 aa27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.11■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.11■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 ALDH1L1O75891 902 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 CSF1RP07333 972 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 HACL1Q9UJ83 578 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 PTPRCP08575 1304 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 CACNA1FO60840 1977 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 C6orf229H3BNL8 230 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 WASHC4Q2M389 1173 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 TAF1P21675 1872 aa27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 GRM8O00222 908 aa27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 CXCL9Q07325 125 aa27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-218ENST00000566180 EYA3Q99504 573 aa27.07■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.07■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.07■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 APLP1P51693 650 aa27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 FOXO4P98177 505 aa27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 RIMBP2O15034 1052 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 POTEIP0CG38 1075 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 POTEJP0CG39 1038 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 ITGA6P23229 1130 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 EPHX2P34913 555 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 FAM161AQ3B820 660 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 GGA1Q9UJY5 639 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 UFL1O94874 794 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-218ENST00000566180 SCNN1DP51172 638 aa27.04■■□□□ 1.92
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