RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 VPS33BQ9H267 617 aa22.27■■□□□ 1.16
USP10-211ENST00000564566 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.27■■□□□ 1.16
USP10-211ENST00000564566 RAD17O75943 681 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 COPS6Q7L5N1 327 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 NLRP10Q86W26 655 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 SP8Q8IXZ3 490 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 BBOX1O75936 387 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 GRAPQ13588 217 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 TNIP1Q15025 636 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 FAM161AQ3B820 660 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 SHTN1A0MZ66 631 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 TCIRG1Q13488 830 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 NEUROD2Q15784 382 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 KRT24Q2M2I5 525 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP10-211ENST00000564566 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 YDJCA8MPS7 323 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 MAP2K2P36507 400 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 MICALL2Q8IY33 904 aa22.18■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 H7C1D1 291 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 TMC4Q7Z404 712 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 COL4A1P02462 1669 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 RIMBP2O15034 1052 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 USP48Q86UV5 1035 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CFAP44Q96MT7 982 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-211ENST00000564566 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 PSMD14O00487 310 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 CA12O43570 354 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 WASHC4Q2M389 1173 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 DLK2Q6UY11 383 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 FAM89AQ96GI7 184 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 C6orf229H3BNL8 230 aa22.13■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.13■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 CHL1O00533 1208 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 HUNKP57058 714 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 RALBP1Q15311 655 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 GPSM2P81274 684 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 DOK7Q18PE1 504 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 ECE2O60344 883 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 NOGQ13253 232 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 ZIC5Q96T25 663 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 POLLQ9UGP5 575 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 EGFRP00533 1210 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 DPF2Q92785 391 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 ADM5C9JUS6 153 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 DGKZQ13574 1117 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 EYA3Q99504 573 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-211ENST00000564566 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-211ENST00000564566 RUNDC1Q96C34 613 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-211ENST00000564566 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-211ENST00000564566 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-211ENST00000564566 RTL9Q8NET4 1388 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-211ENST00000564566 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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