RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 TPM2P07951 284 aa21.62■■□□□ 1.05
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GDE1-203ENST00000564172 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.61■■□□□ 1.05
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GDE1-203ENST00000564172 C4BP0C0L5 1744 aa21.61■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.61■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.6■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 FAM177BA6PVY3 158 aa21.6■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 PROM2Q8N271 834 aa21.6■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.6■■□□□ 1.05
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GDE1-203ENST00000564172 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.59■■□□□ 1.05
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GDE1-203ENST00000564172 AACSQ86V21 672 aa21.57■■□□□ 1.04
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GDE1-203ENST00000564172 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 GYS1P13807 737 aa21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 NFIXQ14938 502 aa21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 CASC1Q6TDU7 716 aa21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 AKT1S1Q96B36 256 aa21.45■■□□□ 1.03
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