RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 AFF2P51816 1311 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GNB5O14775 395 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 AK7Q96M32 723 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GPAMQ9HCL2 828 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 MST1RQ04912 1400 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PIK3R2O00459 728 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 TSPY4P0CV99 314 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 TSPY10P0CW01 314 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SLAIN2Q9P270 581 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PHF24Q9UPV7 400 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 EID1Q9Y6B2 187 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.86□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 BMP4P12644 408 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PDE4DQ08499 809 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 WDR44Q5JSH3 913 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 BRINP3Q76B58 766 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GGA1Q9UJY5 639 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 ADGRL2O95490 1459 aa7.85□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 C2CD2LO14523 706 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 FGD1P98174 961 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 CLN3Q13286 438 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PNMA1Q8ND90 353 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 BTBD6Q96KE9 485 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 LAMC1P11047 1609 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 CLTCL1P53675 1640 aa7.84□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 C8orf37Q96NL8 207 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 KANK1Q14678 1352 aa7.83□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 AP1G2O75843 785 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 GLI3P10071 1580 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 PHKA2P46019 1235 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ERVK-9P63128 1117 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA3Q99758 1704 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RXRBP28702 533 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 DGKGP49619 791 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 LRP5O75197 1615 aa7.81□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 EPXP11678 715 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 GATA4P43694 442 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ARID3AQ99856 593 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RUBCNLQ9H714 662 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 METP08581 1390 aa7.8□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 DCCP43146 1447 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 BTBD11A6QL63 1104 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 SCTRP47872 440 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 CTBSQ01459 385 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 PGBD3Q8N328 593 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ATRNO75882 1429 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GTH6 734 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 FGFR3P22607 806 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 RNF135Q8IUD6 432 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 MYOM2P54296 1465 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms