RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 CPB1P15086 417 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 F8W735 103 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-202ENST00000558300 MED26O95402 600 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 EPB42P16452 691 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 UCN2Q96RP3 112 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TMOD3-202ENST00000558300 SSTR4P31391 388 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 IFT43Q96FT9 208 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 GSC2O15499 205 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 IRAK1P51617 712 aa7.37□□□□□ -1.23
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TMOD3-202ENST00000558300 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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TMOD3-202ENST00000558300 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 COBLO75128 1261 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 ALX3O95076 343 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 IGLV1-40P01703 118 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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TMOD3-202ENST00000558300 IDH3AP50213 366 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 WWC1Q8IX03 1113 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 NGLY1Q96IV0 654 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 RAXQ9Y2V3 346 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-202ENST00000558300 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.34□□□□□ -1.23
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TMOD3-202ENST00000558300 ARSDP51689 593 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-202ENST00000558300 SEC13P55735 322 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-202ENST00000558300 SETDB1Q15047 1291 aa7.33□□□□□ -1.24
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TMOD3-202ENST00000558300 RARAP10276 462 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-202ENST00000558300 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-202ENST00000558300 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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TMOD3-202ENST00000558300 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-202ENST00000558300 RNF114Q9Y508 228 aa7.3□□□□□ -1.24
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TMOD3-202ENST00000558300 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.29□□□□□ -1.24
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TMOD3-202ENST00000558300 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.28□□□□□ -1.24
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TMOD3-202ENST00000558300 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-202ENST00000558300 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TMOD3-202ENST00000558300 J3QW42 95 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-202ENST00000558300 GLB1P16278 677 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-202ENST00000558300 WEE1P30291 646 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-202ENST00000558300 PTK7Q13308 1070 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-202ENST00000558300 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.25□□□□□ -1.25
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