RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.6■■□□□ 1.69
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZIC5Q96T25 663 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.58■■□□□ 1.69
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CTDSP2-204ENST00000548823 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.58■■□□□ 1.69
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CTDSP2-204ENST00000548823 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDSP2-204ENST00000548823 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDSP2-204ENST00000548823 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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CTDSP2-204ENST00000548823 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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CTDSP2-204ENST00000548823 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CTDSP2-204ENST00000548823 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CTDSP2-204ENST00000548823 RIPK4P57078 832 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDSP2-204ENST00000548823 NFE2L2Q16236 605 aa25.54■■□□□ 1.68
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CTDSP2-204ENST00000548823 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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CTDSP2-204ENST00000548823 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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CTDSP2-204ENST00000548823 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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CTDSP2-204ENST00000548823 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC102AQ96A19 550 aa25.49■■□□□ 1.67
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CTDSP2-204ENST00000548823 USP48Q86UV5 1035 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF186Q9NXI6 227 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-204ENST00000548823 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP3Q96P20 1036 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 PLIN1O60240 522 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 NTSR2O95665 410 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 DLK2Q6UY11 383 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 PDE3AQ14432 1141 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDSP2-204ENST00000548823 SP8Q8IXZ3 490 aa25.4■■□□□ 1.66
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CTDSP2-204ENST00000548823 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 DPF2Q92785 391 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 DCTN1Q14203 1278 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.38■■□□□ 1.65
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CTDSP2-204ENST00000548823 YDJCA8MPS7 323 aa25.37■■□□□ 1.65
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