RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 JCADQ9P266 1359 aa11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1-202ENST00000546471 PXDNQ92626 1479 aa11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CAVIN2O95810 425 aa11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TRIM5Q9C035 493 aa11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM177BA6PVY3 158 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF75DP51815 510 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PSME1Q06323 249 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 GTF3C6Q969F1 213 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 MRC1P22897 1456 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BQV1 296 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TAF5LO75529 589 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 IFFO2Q5TF58 517 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 NR1I2O75469 434 aa11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF165P49910 485 aa11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 NEK1Q96PY6 1258 aa11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CFAP45Q9UL16 551 aa11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 JAK2O60674 1132 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 RESTQ13127 1097 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 BRF1Q92994 677 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV5-2P06315 115 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5JP18859 108 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD7Q92527 254 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PGBD1Q96JS3 809 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC25BP30305 580 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 LRMPQ12912 555 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZUG5 572 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 SMTNL1A8MU46 457 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CBX1P83916 185 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 FGD1P98174 961 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 DMTNQ08495 405 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 GCKRQ14397 625 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PDIA6Q15084 440 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE5O15320 804 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 COPRSQ9NQ92 184 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 SYCP1Q15431 976 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 TNNI3KQ59H18 835 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX11Q96FC9 970 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RRN3P1-202ENST00000546471 GCP02774 474 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 TNNT1P13805 278 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 MYL6BP14649 208 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 STX1AQ16623 288 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 MYD88Q99836 296 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 COL15A1P39059 1388 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP2B3Q16720 1220 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 SARM1Q6SZW1 724 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF609O15014 1411 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms