RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 TNNQ9UQP3 1299 aa22.36■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.36■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 PRELPP51888 382 aa22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 OLFM4Q6UX06 510 aa22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.35■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 PDE8AO60658 829 aa22.34■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 ALDH1L1O75891 902 aa22.34■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.34■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 ABCC4O15439 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 PCNTO95613 3336 aa22.33■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 FSTL1Q12841 308 aa22.33■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 WDR90Q96KV7 1748 aa22.33■■□□□ 1.17
LATS1-205ENST00000542720 KIF16BQ96L93 1317 aa22.32■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 TNS4Q8IZW8 715 aa22.32■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 TAF1P21675 1872 aa22.32■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 GRM8O00222 908 aa22.31■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.31■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.31■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 CTSWP56202 376 aa22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 RASSF7Q02833 373 aa22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 COL4A1P02462 1669 aa22.3■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 NFKBIEO00221 500 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 TRIM27P14373 513 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 GRAPQ13588 217 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.29■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.28■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.28■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.28■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 FOXO4P98177 505 aa22.27■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.27■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 SUCLG2Q96I99 432 aa22.27■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 USP44Q9H0E7 712 aa22.27■■□□□ 1.16
LATS1-205ENST00000542720 BBOX1O75936 387 aa22.26■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 CCDC93Q567U6 631 aa22.26■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 GREM2Q9H772 168 aa22.26■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 UTYO14607 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 CSF1RP07333 972 aa22.25■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 KAZALD1Q96I82 304 aa22.25■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.25■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.25■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 SOGA3Q5TF21 947 aa22.24■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 SP8Q8IXZ3 490 aa22.24■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 RRAGCQ9HB90 399 aa22.23■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.23■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 MYH3P11055 1940 aa22.22■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 FAM161AQ3B820 660 aa22.22■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.22■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.22■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 SNED1Q8TER0 1413 aa22.22■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 RNF181Q9P0P0 153 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
LATS1-205ENST00000542720 PLIN1O60240 522 aa22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 RLBP1P12271 317 aa22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 ITGA6P23229 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 MEIS3Q99687 375 aa22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 SBF1O95248 1867 aa22.2■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 LMNB1P20700 586 aa22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 RTL9Q8NET4 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 TMC4Q7Z404 712 aa22.18■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.18■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.17■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 MPNDQ8N594 471 aa22.17■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.17■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 PANK1Q8TE04 598 aa22.17■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.16■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LATS1-205ENST00000542720 GPSM2P81274 684 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms