RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-215ENST00000539613 AOC2O75106 756 aa27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-215ENST00000539613 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-215ENST00000539613 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-215ENST00000539613 RAD17O75943 681 aa27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF428Q96B54 188 aa27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.19■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 BBOX1O75936 387 aa27.19■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 COPS6Q7L5N1 327 aa27.19■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 NLRP10Q86W26 655 aa27.19■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM161AQ3B820 660 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 SP8Q8IXZ3 490 aa27.18■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC85CA6NKD9 419 aa27.17■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 GRAPQ13588 217 aa27.17■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 TNIP1Q15025 636 aa27.17■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.16■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa27.15■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP2K2P36507 400 aa27.15■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.15■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 TCIRG1Q13488 830 aa27.14■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.14■■□□□ 1.94
RHBDD1-215ENST00000539613 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 NEUROD2Q15784 382 aa27.13■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 SHTN1A0MZ66 631 aa27.12■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CFAP44Q96MT7 982 aa27.12■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 H7C1D1 291 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 KRT24Q2M2I5 525 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 MICALL2Q8IY33 904 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 YDJCA8MPS7 323 aa27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 TMC4Q7Z404 712 aa27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 CA12O43570 354 aa27.09■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RHBDD1-215ENST00000539613 RIMBP2O15034 1052 aa27.07■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 WASHC4Q2M389 1173 aa27.07■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.07■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 COL4A1P02462 1669 aa27.06■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 C6orf229H3BNL8 230 aa27.06■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 USP48Q86UV5 1035 aa27.06■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 PSMD14O00487 310 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 HUNKP57058 714 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 SAMD7Q7Z3H4 446 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM89AQ96GI7 184 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 NOGQ13253 232 aa27.03■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 RALBP1Q15311 655 aa27.03■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.03■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 ECE2O60344 883 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 DLK2Q6UY11 383 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD1-215ENST00000539613 SCN9AQ15858 1988 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 CHL1O00533 1208 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 GPSM2P81274 684 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 DGKZQ13574 1117 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 DOK7Q18PE1 504 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 DPF2Q92785 391 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 EYA3Q99504 573 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 ADM5C9JUS6 153 aa26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 EGFRP00533 1210 aa26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 ZIC5Q96T25 663 aa26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 POLLQ9UGP5 575 aa26.99■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 RTL9Q8NET4 1388 aa26.97■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 G3V3G9 751 aa26.97■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
RHBDD1-215ENST00000539613 HOXB7P09629 217 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms