RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536645.1

DYRK4-204, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 3

Gene DYRK4, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-204	ENST00000536645	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DYRK4-204	ENST00000536645	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ZMYND10	O75800	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	FST	P19883	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	TOM1	O60784	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645		A0A1W2PNR3	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	SIN3B	O75182	1162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	LRP6	O75581	1613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	EP400	Q96L91	3159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	LILRB5	O75023	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ATP4A	P20648	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PZP	P20742	1482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	NOS3	P29474	1203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	LRP5	O75197	1615 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	A2M	P01023	1474 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DYRK4-204	ENST00000536645	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	ADH7	P40394	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	TGFB1	P01137	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	AK7	Q96M32	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	TNR	Q92752	1358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	EFS	O43281	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	WNT11	O96014	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	SLIT1	O75093	1534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	SPINK2	P20155	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYRK4-204	ENST00000536645	TLR1	Q15399	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms