RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533903.1

ZBED5-208, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 3,214 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5-208ENST00000533903 CACNA1FO60840 1977 aa8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 ITPK1Q13572 414 aa8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 AKT1S1Q96B36 256 aa8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 KIF16BQ96L93 1317 aa8.29□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 KIF4AO95239 1232 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.28□□□□□ -1.08
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ZBED5-208ENST00000533903 C4BP0C0L5 1744 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 MCM6Q14566 821 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 SLC15A2Q16348 729 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.28□□□□□ -1.08
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ZBED5-208ENST00000533903 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 USP16Q9Y5T5 823 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 IGHDP01880 384 aa8.27□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
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ZBED5-208ENST00000533903 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.27□□□□□ -1.08
ZBED5-208ENST00000533903 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.27□□□□□ -1.08
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ZBED5-208ENST00000533903 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 DRC1Q96MC2 740 aa8.27□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.27□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.26□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 GNPATO15228 680 aa8.26□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 MCM5P33992 734 aa8.26□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.26□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 COL15A1P39059 1388 aa8.26□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 TRIM66O15016 1216 aa8.25□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.25□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 KSR2Q6VAB6 950 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 NBPF15Q8N660 670 aa8.24□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.24□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 SKAP1Q86WV1 359 aa8.24□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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ZBED5-208ENST00000533903 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 PMM1Q92871 262 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 RINLQ6ZS11 566 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 COPS6Q7L5N1 327 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.23□□□□□ -1.09
ZBED5-208ENST00000533903 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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