RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.57■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 ATP8B2P98198 1209 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 NLRP3Q96P20 1036 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 PTGER2P43116 358 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 RTL9Q8NET4 1388 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 SPON1Q9HCB6 807 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 SRGAP3O43295 1099 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 A0A1B0GUL6 1792 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 LRP5O75197 1615 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 POLA2Q14181 598 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 FAM161AQ3B820 660 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 CRY2Q49AN0 593 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 SSH3Q8TE77 659 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 GREM2Q9H772 168 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-217ENST00000531951 COL4A1P02462 1669 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 HMMRO75330 724 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 PDE6BP35913 854 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 ITGA6P23229 1130 aa23.49■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.49■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.47■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.47■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 SLX4Q8IY92 1834 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-217ENST00000531951 IGHDP01880 384 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 SRGNP10124 158 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 COPRSQ9NQ92 184 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 NPR1P16066 1061 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 H0YIN7 160 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 MASTLQ96GX5 879 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 DCTPP1Q9H773 170 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 TGFB2P61812 414 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 GRAPQ13588 217 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 STYK1Q6J9G0 422 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 FBXO3Q9UK99 471 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CHRNA5P30532 468 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 SIL1Q9H173 461 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-217ENST00000531951 CIAO1O76071 339 aa23.39■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 SMC5Q8IY18 1101 aa23.39■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 GCC1Q96CN9 775 aa23.39■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.39■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 EYA2O00167 538 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 ALDH1B1P30837 517 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 LTBP1Q14766 1721 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 DPEP1P16444 411 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.334e-6■■■■□ 22.1
PUF60-217ENST00000531951 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 KLHL34Q8N239 644 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 A0A0G2JLW4 131 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 BBOX1O75936 387 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-217ENST00000531951 KCNA3P22001 575 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms