RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.31■□□□□ 0.52
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PTPRU-209ENST00000526080 PDIA6Q15084 440 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 SP8Q8IXZ3 490 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRU-209ENST00000526080 ZIC5Q96T25 663 aa18.3■□□□□ 0.52
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PTPRU-209ENST00000526080 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.29■□□□□ 0.52
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PTPRU-209ENST00000526080 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
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PTPRU-209ENST00000526080 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.26■□□□□ 0.51
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PTPRU-209ENST00000526080 CFAP44Q96MT7 982 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-209ENST00000526080 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRU-209ENST00000526080 COL4A1P02462 1669 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRU-209ENST00000526080 USP48Q86UV5 1035 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRU-209ENST00000526080 H7C1D1 291 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRU-209ENST00000526080 EGFRP00533 1210 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRU-209ENST00000526080 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.21■□□□□ 0.51
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PTPRU-209ENST00000526080 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRU-209ENST00000526080 RTL9Q8NET4 1388 aa18.2■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 CCDC102AQ96A19 550 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 HTTP42858 3142 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF609O15014 1411 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-209ENST00000526080 SLC10A3P09131 477 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-209ENST00000526080 WASHC4Q2M389 1173 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-209ENST00000526080 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.17■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 POLLQ9UGP5 575 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-209ENST00000526080 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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PTPRU-209ENST00000526080 TRPA1O75762 1119 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 GPSM2P81274 684 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 CSRNP1Q96S65 589 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 PSME4Q14997 1843 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 RIMBP2O15034 1052 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 NECTIN2Q92692 538 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRU-209ENST00000526080 GGA3Q9NZ52 723 aa18.12■□□□□ 0.49
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