RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 CYP4X1Q8N118 509 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 LY75O60449 1722 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.23□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 RREB1Q92766 1687 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 EXOC5O00471 708 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 HOXA2O43364 376 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 PHKG2P15735 406 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 PRKAR2BP31323 418 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 HLA-CQ95604 372 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 DACH1Q9UI36 760 aa7.22□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.21□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.21□□□□□ -1.25
MSRA-208ENST00000522907 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 WNT7AO00755 349 aa7.21□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TRIM32Q13049 653 aa7.21□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 NUDCQ9Y266 331 aa7.21□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CCER2I3L3R5 266 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 KCNQ2O43526 872 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 PDE3BQ13370 1112 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MRS2Q9HD23 443 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MAP3K5Q99683 1374 aa7.2□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MS4A1P11836 297 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 IL17REQ8NFR9 667 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 LGR6Q9HBX8 967 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SPG7Q9UQ90 795 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.19□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TRIM37O94972 964 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 DCAF5Q96JK2 942 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TJP1Q07157 1748 aa7.18□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SOCS7O14512 581 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 AXIN1O15169 862 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 GUCA2AQ02747 115 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 NFE2L2Q16236 605 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 PIGBQ92521 554 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 RUNDC1Q96C34 613 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.17□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SMPD1P17405 629 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 C5P01031 1676 aa7.16□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 APAF1O14727 1248 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 PLSCR1O15162 318 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 JUNDP17535 347 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 WNT7BP56706 349 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 DCTN1Q14203 1278 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 MCM10Q7L590 875 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 RETREG3Q86VR2 466 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CCDC125Q86Z20 511 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 ZNF521Q96K83 1311 aa7.15□□□□□ -1.26
MSRA-208ENST00000522907 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms